MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 34052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_014002	GCA	2	6	2008827	2008832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496675
34002	NC_014002	ACTGTA	2	12	2008866	2008877	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294496675
34003	NC_014002	ATC	2	6	2008907	2008912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496675
34004	NC_014002	T	6	6	2008963	2008968	0 %	100 %	0 %	0 %	294496675
34005	NC_014002	CTG	2	6	2009053	2009058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496675
34006	NC_014002	AGC	2	6	2009133	2009138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496675
34007	NC_014002	A	6	6	2009151	2009156	100 %	0 %	0 %	0 %	294496675
34008	NC_014002	AGC	2	6	2009175	2009180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496675
34009	NC_014002	AT	3	6	2009191	2009196	50 %	50 %	0 %	0 %	294496675
34010	NC_014002	CAT	2	6	2009224	2009229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496675
34011	NC_014002	T	6	6	2009305	2009310	0 %	100 %	0 %	0 %	294496675
34012	NC_014002	CCA	2	6	2009329	2009334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496675
34013	NC_014002	AGGAGC	2	12	2009348	2009359	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	294496675
34014	NC_014002	TGG	2	6	2009416	2009421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496675
34015	NC_014002	GAT	2	6	2009553	2009558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496676
34016	NC_014002	GGC	2	6	2009582	2009587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496676
34017	NC_014002	TTA	2	6	2009593	2009598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496676
34018	NC_014002	TCA	2	6	2009663	2009668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496676
34019	NC_014002	TCA	2	6	2009849	2009854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496676
34020	NC_014002	CAG	2	6	2009891	2009896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496676
34021	NC_014002	TTC	2	6	2009904	2009909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496676
34022	NC_014002	CAA	2	6	2009943	2009948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496676
34023	NC_014002	CAG	2	6	2009991	2009996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496676
34024	NC_014002	A	6	6	2010003	2010008	100 %	0 %	0 %	0 %	294496676
34025	NC_014002	TA	3	6	2010042	2010047	50 %	50 %	0 %	0 %	294496676
34026	NC_014002	A	6	6	2010063	2010068	100 %	0 %	0 %	0 %	294496676
34027	NC_014002	CCA	2	6	2010085	2010090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496676
34028	NC_014002	CAT	2	6	2010195	2010200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496676
34029	NC_014002	A	6	6	2010241	2010246	100 %	0 %	0 %	0 %	294496676
34030	NC_014002	TTAT	2	8	2010346	2010353	25 %	75 %	0 %	0 %	294496676
34031	NC_014002	T	7	7	2010366	2010372	0 %	100 %	0 %	0 %	294496676
34032	NC_014002	A	6	6	2010503	2010508	100 %	0 %	0 %	0 %	294496676
34033	NC_014002	AAGAA	2	10	2010534	2010543	80 %	0 %	20 %	0 %	294496676
34034	NC_014002	AAG	2	6	2010587	2010592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496676
34035	NC_014002	ACA	2	6	2010908	2010913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496677
34036	NC_014002	TCA	2	6	2011080	2011085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496677
34037	NC_014002	CAA	2	6	2011128	2011133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496677
34038	NC_014002	GTCA	2	8	2011138	2011145	25 %	25 %	25 %	25 %	294496677
34039	NC_014002	TTC	2	6	2011182	2011187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496677
34040	NC_014002	GCT	2	6	2011223	2011228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496677
34041	NC_014002	ACTG	2	8	2011254	2011261	25 %	25 %	25 %	25 %	294496677
34042	NC_014002	ATCAAG	2	12	2011297	2011308	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294496677
34043	NC_014002	TCC	2	6	2011327	2011332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294496677
34044	NC_014002	AGA	2	6	2011378	2011383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496677
34045	NC_014002	ATTTAT	2	12	2011407	2011418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496677
34046	NC_014002	GCC	2	6	2011441	2011446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496677
34047	NC_014002	GTA	2	6	2011532	2011537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496677
34048	NC_014002	TACC	2	8	2011545	2011552	25 %	25 %	0 %	50 %	294496677
34049	NC_014002	AAC	2	6	2011690	2011695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496677
34050	NC_014002	ATTACG	2	12	2011720	2011731	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294496677
34051	NC_014002	CCT	2	6	2011766	2011771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294496677
34052	NC_014002	TTC	2	6	2011834	2011839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496677

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.